Yökoripallon tarina alkoi USA:ssa, kun nuoriso-ohjaajat ottivat mukaansa kasettisoittimen ja lähtivät koripallokentän reunalle luomaan yhteyksiä nuoriin, synnyttäen näin yökoripallotoiminnan. Saksassa toimintaa pyöritettiin menestyksekkäästi, ja Suomeen konsepti toi Ilpo Laitinen, HNMKY:n nuorisosihteeri.

Vuonna 1998 alkoi Kuutamokoripallo-projekti VR:n makasiineilla, ja RAY:n rahoitus tuki toimintaa vuosina 1999-2000. Ensimmäiset yökoripallo-ottelut pelattiin VR:n makasiineilla ja Ruoholahden Arena Centerissä. Reino Kaasalainen liittyi mukaan toimintaan NK:n edustajana.

Kaisaniemen puistossa kesäisin järjestetty yökoripallo sai pysyvän toimipisteen Myllypurosta, Paragon-hallista. Vuonna 2001 NK otti päävastuun toiminnasta, vaikka HNMKY pysyi yhtenä kumppanina. RAY:n uusi rahoitus vuonna 2002 tuki HNMKY:n ja NK:n yhteistyötä.

Vuonna 2004 yökoripallo sai tunnustusta parlamentilta (nykyisin Impact) ja seuraavana vuonna Helsingin Sanomien NYT-liitteen ja Radio Helsingin Unelmien Helsinki palkitsivat toiminnan. Vuonna 2005 toiminta laajeni Hietaiemen uimarannalle ja Laakavuoren lauantaikahviloihin.

Vuonna 2007 toiminta siirtyi Myllypuron Paragon-hallista nuorisotaloille ja muihin tiloihin. Syksyllä sama vuosi näki yökoripallon kiertueen eri nuorisotaloilla ympäri Helsinkiä. Vuonna 2014 toiminta sai ansaitun Nuorisotyön tunnustuspalkinnon, osoituksena sen merkittävästä vaikutuksesta nuorten elämään.